Mr. Driller tiene la jugabilidad de un puzzle atemporal al que se le han añadido seis nuevos personajes, más de 40 niveles, varios modos de juego y acción a doble pantalla, que le da un toque de estrategia al poder ver de antemano qué bloques van a caer desde arriba.
Entre ellos tenemos el modo Misión, en el que iremos excavando por lugares cada vez más profundos y desafiantes; el modo Time Attack para luchar contra nuestros contrincantes a contrarreloj para cumplir los objetivos marcados; y el novedoso modo Dristone, donde usaremos un taladro para abrirnos camino en un laberinto de piedras para recoger los Dristones. Esto nos servirá para obtener ventajas y bonificaciones.
